ATAC技术服务

提供商 ：microgene

服务名称 ：atac

1、样本：植物组织、细胞等；

2、步骤：
样本的前处理，抽提，质检；
基于华大T7测序平台，进行文库的测序；
数据下机，并完成生物信息分析内容。

3、1.测序原始reads去接头，质量控制
2.参考基因组比对
3.富集区域鉴定（PeakCalling）
4.Peak注释
5.Peak相关基因 GO 分析
6.Peak相关基因 KEGG分析
7.富集区域 motif 分析
8.组 间 差 异 Peak 相关基因筛选与GO功能聚类分析、KEGG 分析
SE（超级增强子）分析：
1.测序原始reads去接头，质量控制
2.参考基因组比对（Mapping）
3.富集区域鉴定（PeakCallling）
4.普通增强子与超级增强子鉴定
5.普通增强子与超级增强子差异（数目）
6.普通增强子与超级增强子信号富集图绘制
7.超级增强子注释与靶基因预测
8.超级增强子调控靶基因KEGG、GO分析
9.超级增强子结合转录因子预测