E1A残留DNA(qPCR)检测试剂盒

E1A残留DNA(qPCR)检测试剂盒

价格: ¥8800

品牌:爱必信(absin)

货号:abs60549

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保质期 :试剂盒应在-20℃条件下保存,有效期为 12 个月。开封后未使用完的试剂盒注意仍在规定储存条件下保存。

供应商 :爱必信(上海)生物科技有限公司

保存条件 :试剂盒应在-20℃条件下保存,有效期为 12 个月。开封后未使用完的试剂盒注意仍在规定储存条件下保存。

规格 :100T

概述  
描述 FDA提醒使用HEK293T细胞生产病毒载体时除应检测SV40 LTA抗原序列,还需要检测残留的腺病毒E1A 序列。CDE 2022年5月颁布的《体内基因治疗产品药学研究与评价技术指导原则》也提到,如使用HEK293T细胞进行病毒载体生产,需进行SV40大T抗原DNA残留、E1A基因DNA残留检测。
        E1A残留DNA(qPCR)检测试剂盒可用于定量检测生物制品中宿主细胞,如 HEK293、293T 细胞等来源的 E1A 残留 DNA量的专用试剂盒,具有专一性强,灵敏度高等特点,可以快速、特异地检测半成品、中间品以及成品中E1A DNA残留。本试剂盒与细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用,可准确定量样品中残留的微量 E1A DNA。
        建议所有使用该试剂盒的实验室按需可做以下验证:标准品线性、 样本线性、 准确度(加标回收率)、定量限、精密度(重复性)、 分析特异性以及阴性参考品符合率。 
        样本线性:依据 YY/T 1182-2020 的相关要求,在线性范围内,取接近线性范围上限的高值样本按一定比例(如 5 倍或 10 倍)稀释为至少 5 种浓度,其中低值浓度样本须接近线性范围的下限,将每一浓度样本检测 1 次或多次,计算每一浓度的对数均值和稀释比例(或理论浓度)的对数值,以浓度的对数均值为 Y,稀释比例(或理论浓度)的对数值为 X 进行线性拟合,计算其线性相关系数 r。 
        分析特异性验证:验证需避免工艺杂质对检测结果的干扰,必要时可对样本进行核酸提取纯化。为避免基质干扰和保证检测有效性建议使用纯度较高的 DNA 进行相应稀释后来做验证。 
        精密度/定量限:验证时,如需同时配制标曲,需控制 CV,避免重复操作过多,CV 偏大影响标曲建立和精密度/定量限验证。 
        数据分析:由于仪器不同,数据阈值线会存在区别,故在数据分析时需依据实际情况统一阈值线再进行数据分析比较。 
        样本核酸提取纯化:可与“宿主细胞残留 DNA(磁珠法)样本前处理试剂盒”配合使用。该试剂盒主要用于生物制品样本中微量核酸的提取,可精准抽提各种生物制品中宿主细胞残留 DNA,适 用于多种基质缓冲溶液,可有效提取纯化微量的 DNA。
产品特点:
精密度高:低浓度重复性CV值<20%;中高浓度重复性CV值<15%
灵敏度高:定量限为40 copies/μL
快速高效:检测快速,一小时即可出结果
产品性能指标:
线性范围:4×106 copies/µL~4×101 copies/µL。
标准品线性:R2≥0.980,扩增效率 90%≤Eff(%)≤110%,各浓度检测值 CV<15%。 
准确度(加标回收率):70%-130%。 
定量限:4×101 copies/µL,CV≤20%,测量偏差不大于|±20%|。 
精密度(重复性):高、中两个浓度参考品各 10次,变异系数CV<15%。 
分析特异性:考察生物制品生产中常用的 DNA 对检测试剂盒的干扰,干扰组应与对照组重合,未见干扰。
阴性参考品符合率:NTC 为 Undetermined 或 Ct 值>35。
适用机型(包括但不限于):ABI QuantStudio 3,ABI 7500,Bio-Rad CFX Opus96 等。 
冻融稳定性:5 次以上。
检验原理 依据《美国药典》<509>通则和<1130>以及《中国药典》通则<3407> 中的各种检测方法,最终选择更准确、可靠、科学的荧光探针(TaqMan ®)qPCR 法作为细胞残留 DNA 检测的方法。TaqMan ®荧光探针是一种寡核苷酸探针,其 5’末端携带荧光基团(报告基团),如 FAM、TET、VIC等,3’端携带淬灭基团,如 TAMRA、BHQ1 等。PCR 扩增时在加入一对引物的同时加入一条特异性的荧光探针,探针完整时,荧光基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收。PCR 扩增时,Taq 酶的 5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统(荧光定量 PCR 仪)可接收到荧光信号,即每扩增一条 DNA 链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与 PCR 产物形成完全同步。该方法具有特异性强、灵敏度高等特点,在目前生物制药细胞核酸残留检测中被广泛使用。
产品组成
编号 组成 规格 储存条件
1 E1A Primer&Probe MIX 550µL -20℃避光保存
2 2×qPCR Reaction MIX 1.6mL -20℃
3 线性化 DNA 定量参考品(4×108copies/µL) 50µL -20℃
4 DNA稀释液 1.5mL×3 -20℃
用途说明 E1A 残留 DNA(qPCR)检测试剂盒具有专一性强,灵敏度高等特点,可以快速、特异地定量检测生物制品半成品、 中间品以及原液和成品中宿主细胞(如 HEK293、293T 细胞等)中 E1A 和 SV40LTA DNA 残留的专用试剂盒。
使用方法 一、准备工作:
1、试剂盒准备: 
将试剂盒各组分置于冰上或 4℃,确保充分溶解后开始操作。
2、需自备的耗材及设备: 
(1)荧光定量 PCR 仪、涡旋仪、离心机 
(2)高精度移液器及一次性无菌无酶低吸附带滤芯吸头(0.5-10µL、10-100µL、20-200µL、100-1000µL) 
(3)1.5mL 无菌无酶低吸附离心管 
(4)无菌无酶八联管或 96 孔 qPCR 板
二、操作流程:
1、操作详细步骤: 
(1)qPCR 反应液的制备: 
   ①根据所需检测的参考品和待测样品数量(一般做 3 组复孔), 分别计算反应所需孔数: 
   反应孔数=(参考品 ST1-6+1 个无模板对照 NTC+待测样品)×3 
   ②根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量: 
   qPCR MIX =(反应孔数+2 或 3)×15μL(2×qPCR Reaction MIX)+ 
(反应孔数+2 或 3)×5μL(E1A Primer&Probe MIX)(2 或 3 为操作损失量) 
   ③将所用试剂置于冰上完全溶解,轻微振荡混匀,瞬时离心,按下表所示配制:
表 2 qPCR MIX 配制表
组分 单个反应量
2×qPCR Reaction MIX 15μL
E1A Primer&Probe MIX 5μL
总体积 20μL

    ④将配制的 qPCR MIX,轻微振荡混匀,瞬时离心,按 20μL/孔分装至八联管或者 96 孔板中。 
    ⑤将DNA稀释液按10μL/孔加到分装了 qPCR MIX 八联管或者 96 孔板中,具体加样见表 4。 
(2)定量参考品的稀释: 
(注:根据试剂盒提供的标准品按照需求配制)
用试剂盒提供的DNA稀释液将DNA定量参考品(4×108copies/µL)系列倍比(稀释倍数:10倍)稀释,稀释浓度依次为4×107copies/µL,4×106copies/µL,4×105copies/µL,4×104copies/µL,4×103copies/µL,4×102copies/µL,4×101copies/µL。具体步骤如下:
 ①将试剂盒中的 DNA 定量参考品和 DNA 稀释液置于冰上或 2-8℃条件下融化。待完全溶解后,轻微振荡混匀,离心 3~5 s。 
②取干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6。 
③在 ST0 管中用 DNA 稀释液将 DNA 定量参考品(4×108copies/µL)稀释至 4×107copies/µL,轻微振荡混匀,离心 3~5 s。确保 DNA 定量参考品与DNA 稀释液充分混匀,使用时避免反复冻融。 
④在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6管中分别加入 90μL DNA 稀释液,再进行梯度稀释,稀释方法如下所示:
表 3 DNA 定量参考品的稀释
稀释管 稀释体积 终浓度(copies/µL)
ST1 10 μL ST0+90 μL DNA 稀释液 4×106
ST2 10 μL ST1+90 μL DNA 稀释液 4×105
ST3 10 μL ST2+90 μL DNA 稀释液 4×104
ST4 10 μL ST3+90 μL DNA 稀释液 4×103
ST5 10 μL ST4+90 μL DNA 稀释液 4×102
ST6 10 μL ST5+90 μL DNA 稀释液 4×101

【注】:标准曲线浓度点可根据实际验证结果进行选择,应至少包含 5 个浓度点。
已融化未使用的 DNA 稀释液可在 2-8℃短暂保存,若长期不使用,请储存于-20℃。 稀释方法可根据实验需要进行调整。
(3)qPCR 加样:
   ①将所需试剂置于冰上操作,轻微振荡混匀,瞬时离心,加样(总体积 30μL):
表 4 MIX 各反应孔加样示例

参考品 参考品 ST1-6 各 10μL+所需 qPCR MIX 量 20μL
无模板对照NTC DNA 稀释液各 10μL+所需 qPCR MIX 量 20μL
待测样品 待测样品各 10μL+所需 qPCR MIX 量 20μL


   ②实验可使用无菌无酶的八联管或者 96 孔板进行反应,需去除反应体系中的气泡,并离心至管底准备反应。
(4)qPCR 反应程序参数设置:
以美国 ABI 7500 Real-Time PCR System、软件版本 2.06 为例。
       1)在Experiment Propertie s 页面创建空白新程序如图所示 :

①Experiment name:修改实验名称。
②Experiment type: 选择程序(Quantitation-Standard Curve)。
③Reagents:选择实验方法(TaqMan ® Reagents )。
    2)创建该产品检测探针,选择①界面,点击②创建探针,在TargetName中编辑探针名称并命名,在Reporter③和Quencher④中选择所需的荧光基团和淬灭基团。本产品荧光基团选择FAM,淬灭基团为None,参比荧光为ROX。点击⑤创建样品,在相应的Samplename⑥一栏中命名样品的名称。

    3) 在 Plate Setup ①界面,将标准曲线孔在 Task② 一栏设置为“S”③,并且在 Quantity④一栏分别赋值设为 4×106,4×105,4×104,4×103,4×102,4×101(单位为copies/µL),并且在相应的 Sample name 一栏中命名为ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6。在 Plate Setup ①界面中,将无模板对照 NTC 孔在 Task②一栏设置为“N”⑤,将待测样本孔在Task②一栏设置为“U”⑥,并且在相应的 Sample name 一栏中命名样品的名称。(图例仅供参考)

     4) 设 置 反 应 程 序 :

Stage1 污染消化 Reps:1 50℃ 2min

程序中 60℃ 30s 处设置为荧光收集①; 反应体积 30μL。

Stage2 预变性 Reps:1 95℃ 20s
Stage3 循环反应 Reps:40 95℃ 3s
60℃ 30s

      5) 点 击 Run 界 面 的 “Start Run”按 钮 进 行 PCR 测 定 。

三、结果分析:
以美国 ABI 7500 Real-Time PCR System、软件版本 2.06 为例。
1、在 Analysis 的 Amplification Plot①面板中,点击 Reanalyse②,初步查看扩增曲线的形态是否正常。在 Analysis 的 Standard Curve③面板中,可读取标准曲线的斜率(Slope)、R 2和扩增效率(Eff%)④等。在 Analysis 的 View Well Table⑤面板中,Quantity Mean 一栏可读取待测样本的检测值,单位为copies/µL。(图例仅供参考)

2、结果分析的参数设置需依据具体的机型及使用的软件版本,一般也可由仪器自动判读。

性能  
储存/保存方法 试剂盒应在-20℃条件下保存,有效期为 12 个月。开封后未使用完的试剂盒注意仍在规定储存条件下保存。
注意事项 1、本试剂盒已通过稳定性(冻融等因素)的验证,无需分装。
2、阴性样品(2×qPCR Reaction MIX、Primer&Probe MIX 和 DNA稀释液等)和阳性样品(参考品和待测样品等)的配制和加样环境需区分区域,不可在一个区域内操作,配制人员需穿戴整齐,戴好口罩、手套和穿好洁净服。
3、注意在不同加样步骤间及时更换吸头,避免交叉污染,避免长时开盖,使用移液器移液时,需避免液体挂壁。
4、试剂盒必须在有效期内使用,每次实验均需重新制备相应的标准曲线,不建议不同标准曲线之间混用,不建议不同批次的相关试剂混用。
5、试剂盒内所有组分建议在低温环境融化后使用,且需确保其充分溶解,各组分使用前需充分混匀,以保证试剂的均一性,经混匀的试剂需经短暂离心,以使管壁及盖子上的液体全部集中于管底。若发现DNA 稀释液中有析出物,建议于 37 ℃条件下进行孵育,使 DNA 稀释液完全溶解。
6、只有严格遵守说明书的操作方法,全部使用本试剂盒配套的试剂才能保证最佳检测效果。
7、最终的试验结果与试剂的有效性、操作者的操作方法及试验环境密切相关。
8、公司只对试剂盒本身负责,不对因使用该试剂盒所造成的样本消耗负责,请使用者使用前充分考虑到样本的可能使用量,预留充足的样本。

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