研选外泌体转录组，microRNA和lncRNA组学
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提供商 ：上海研匠生物科技有限公司
服务名称 ：外泌体转录组，microRNA和lncRNA组学
规格 ：周期2周
外泌体转录组，microRNA和lncRNA组学
周期：2周包分析1. 背景：
外泌体天然适于运输蛋白质、mRNA、miRNA、各种非编码RNA、线粒体DNA以及基因组DNA。本实验采用 illumina Hiseq 测序平台的单端50bp测序模式对样本进行高通量测序。原始数据需经过引物与adaptor序列去除，并经过对测序片段碱基的质量检验和长度筛选，最终选择质量可靠的测序片段。然后统计小RNA（sRNA）的种类(用unique表示)及数量（用total表示），并对小RNA做长度分布统计，一般来说，小RNA的长度区间为18～30nt，长度分布的峰能帮助我们判断小RNA的种类，如miRNA集中在21或22nt，siRNA集中在24nt，piRNA集中在30nt。此分析报告来自于 云计算 （云计算资源由 Cloud 提供）。
2. 实验和分析：
microRNA 是一类重要的内源性短非编码RNA，涉及癌症，细胞发育，应激响应 等重要生物学过程，并常具有微量高效的作用特点。使用 fastx_clipper 对原始数据进行接头序列的去除，筛选掉低质量序列，选取长度在14~40(nt)的序列用于下游分析，并对整个筛选过程进行相关统计。
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