935K甲基化芯片

提供商 ：上海旭燃生物科技有限公司

服务名称 ：935K甲基化芯片

DNA甲基化在基因表达调控中扮演着重要的角色，参与生物体多种重要的生命活动。DNA甲基化异常及其对基因表达的影响会导致人类的许多复杂疾病的发生，如癌症、神经疾病和糖尿病等。为了研究甲基化在人体内的重要作用，Illumina推出了新一代的甲基化芯片Infinium Methy lationEPIC v2.0 BeadChip（简称935k芯片）。
935K芯片可检测人全基因组超过 935,000 个 CpG 位点的甲基化状态，去除了 EPICV1.0 性能不佳的探针,新增的 186,000 个 CpG 靶向增强子和超级增强子、更多 CTCF 结合位点、CNV 检测区域、EPIC v1.0 覆盖不足的CpG 岛以及常见 癌症驱动突变，是更适合于表观基因组全关联分析研究（EWAS）的一款芯片。
935k结题报告为压缩包，包括结果图表和网页版结题报告。网页报告可打开文件夹中index.html文件。主要结果主要包括三部分内容：原始数据预处理和标准化，差异甲基化位点分析及差异甲基化区域分析。其中最重要的是差异甲基化位点分析(Methy lation_Variable_Positions)，需要重点关注差异甲基化位点及其关联基因，找到关键的调控因子。
1、全面的基因组覆盖范围：检测> 935,000个CpG位点，全面覆盖CpG岛、启动子、编码区及增强子全基因组分析，无需预先设计特异性探针能够检测未知基因；
2、分辨率高：单碱基分辨率，可以直接检测到发生甲基化的准确位点；
3、可重复性高：自身技术重复间的相关性以及与850K相同探针间的相关性R2 > 0.995；
4、 高质量的数据，沿用了450k芯片的Infinium技术，同时采用Infinium I及II探针设计，使检测范围最大化；

样本类型	建议送样量	保存、运输介质
组织	＞50mg	-80℃保存，干冰运输
细胞	＞2 x 10^6	-80℃保存，干冰运输
血液	＞1ml	-80℃保存，干冰/4度（新鲜）运输
FFPE	A.切片组织面积大于1cm2，切片表面无划痕，无干裂，均匀贴片的石蜡切片； B.切片组织细胞>30000个；有核细胞比例>80%；肿瘤细胞比例>20%，白片厚度5~ 10um，需3-5片，组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上，需提供5-12片； C.石蜡块：厚度4mm以上，组织约绿豆大小以上； D.蜡卷：厚度25um左右，2-5卷	4℃或常温保存和运输
gDNA	＞1ug	-80℃保存，干冰运输