宏基因组

提供商 ：上海百趣医学生物科技有限公司

服务名称 ：宏基因组检测服务

宏基因组(Metagenomics)，也称元基因组，利用新一代高通量测序技术(Next Generation Sequencingtechnology, NGS )以特定环境下微生物群体基因组为研究对象，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。与传统微生物研究方法相比，宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点，因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。

技术优势

通量高，拥有标准化实验室和高通量测序平台，数据库可靠

可检测不可培养物种，可检测痕量微生物

专业的生物信息团队，可以满足个性化的生物信息分析要求

技术路线

技术参数

▶ 样本要求   

土壤：10 g/sample

粪便：3-5 g/sample

血液：10 mL/sample

污泥/沉积物：5-10 g/sample

DNA：总量≥1 μg，浓度≥100 ng/μL              

▶ 检测平台

测序平台：Nova Seq 6000，Illumina

测序方法：PE150

测序深度：6G/10G/12G

▶ 常规项目周期

实验检测：35个自然日

数据分析：7个自然日

应用方向

• 医学领域：代谢病研究、肿瘤癌症研究等
• 畜牧领域：肠道、瘤胃(如产甲烷菌类群)与动物健康/营养消化研究等
• 农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落研究等
• 环境领域：雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境研究等
• 生物能源：特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发研究
• 特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究