甲基化研究服务

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服务名称 :甲基化研究

提供商 :上海泉脉生物科技有限公司

1. 甲基化芯片

Infinium HumanMethylationEPIC BeadChip(850K甲基化芯片)
850K芯片可检测人全基因组853,307个CpG位点的甲基化状态,其中包含原450K芯片91%的位点和新增的413,745个位点,该芯片不仅保持了对CpG岛和基因启动子区的全面覆盖,还加强了FANTOM5增强子区、ENCODE染色质以及ENCODE转录因子结合位点的探针覆盖。广泛用于干细胞研究、肿瘤和其他复杂疾病的研究,是全表观基因组全关联研究的理想之选。

2. 焦磷酸测序

在表观遗传学中,DNA甲基化是最具有特点的表观遗传学修饰,甲基化水平的异常与多种疾病都有关联。近年来,利用新一代的检测方法得到了大量的全基因组甲基化特征数据,后期急需要验证其中特定靶序列与表观遗传修饰的生理相关性。

焦磷酸测序可在一次检测中快速定量一个或多个甲基化位点,是目前最理想的验证方法。因此该技术在表观遗传学研究中逐渐成为数据分析的金标准。
本公司基于QIAGEN公司的PyroMark Q96 ID平台,解决了常规焦磷酸测序法在非CpG位点胞嘧啶转化为胸腺嘧啶时影响到引物结合的问题,进一步提高了结果的准确性;同时,给予的结果除了能准确定性检测到位点变化情况之外,还能精确的计算到频率变化。

2. 1 Pyrosequencing原理


2.2 PyroMark流程:

2. 3技术优势

先进的算法设计可优化最佳的实验条件,内嵌式的质控保证数据的准确可靠,全程的软件控制减少人为因素的影响;

灵敏度高,可测到邻近CpG区域的单个甲基化水平,甚至包括测序的引物区域;
周期短、通量高,1h内可同时平行分析96个样本,一次运行可实现多个连续CpG位点定量分析;
除常规的检测位点变化情况外,还可准确计算频率变化;
对于检测位点要求低,可检测未知序列信息,覆盖到人类基因组的所有CpG位点;
对于样品要求低,适用于新鲜、冷冻和FFPE样本;

3. Sequenom 质谱法

Sequenom质谱法将稳健的单碱基引物延伸反应与灵敏可靠的MALDI-TOF质谱检测的优点相结合,提供了高灵敏性低成本的检测服务。
服务特点:
灵活性好 一张芯片上,样本的数量和位置、样本和位点的配对均可以自由选择。
准确度高 直接检测待测物分子量,准确度超过99.7%。
通量高 一张芯片上可完成384个样品的多重iPLEX GOLD实验,每个反应孔可实现多达40重反应,通量范围每天从几百到十万个。
性价比高 无需荧光标记,即使是低通量,成本仍然很低。
专业便捷 专业的引物设计以及基因分型软件,所有反应只需标准一致的PCR以及分子延伸反应条件。

适用范围:尤其适合于位点小于200个,样本量大于500份的项目

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