10Xgenomics单细胞转录组测序

10Xgenomics单细胞转录组测序

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提供商 :上海中科新生命生物科技有限公司

服务名称 :10Xgenomics单细胞转录组测序

· 产品定义

10Xgenomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞,然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合,被油滴包裹形成油包水结构,实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平转录表达信息,并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释,实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互作用等分析内容,从而获得高分辨率的细胞图谱。

 

· 技术路线

 

· 平台优势

· 完备的细胞捕获平台(Chromium Controller仪器和Chromium X Series仪器);
· 丰富的样本处理经验(如人/鼠等多个物种的脑/心脏/肝/肺/脾/肾/肠/胃等多种器官组织样本);
· 高标准实验环境,进口试剂耗材,最大限度消除各种不良因素影响,保障建库质量;
· 强大的生信团队,可根据客户需求提供标准化、个性化的数据分析解决方案。

 

· 数据分析

 

· 部分数据分析结果展示

 

· 推荐应用领域

1. 细胞图谱的构建

2. 细胞异质性及组织微环境研究

3. 免疫调控研究

4. 神经分化发育研究

5. 疾病机制研究

6. 药物动力学研究

 

· 样本要求(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-06606761)

1. 样品总量:制备成细胞悬浮液,一个样本的细胞起始量需大于1×10 5个;

2. 样品浓度:最终上样捕获前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL;

3. 细胞活性:活细胞数目在85 %以上;

4. 细胞大小:直径小于40 μm;

5. 细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质;

6. 血液样本需要用EDTA抗凝管收集,不能采用含有肝素的抗凝管;

7. 植物样本需制备成原生质体。

 

· 推荐组合产品

1. 单细胞转录组+bulk RNA-seq/蛋白组学;

2. 单细胞转录组+空间组学(空间转录组/空间代谢组);

3. 单细胞转录组+16s/宏基因组+代谢组;

4. 单细胞转录组+基因组(WES/WGS)。

 

· 参考文献

1.Shengqian Dou,et al,Molecular identity of human limbal heterogeneity involved in corneal homeostasis and privilege.Ocular Surface.2021.DOI:10.1016/j.jtos.2021.04.010.

2.Li SB,et al.Hyperexcitable arousal circuits drive sleep instability during aging.Science.2022.doi: 10.1126/science.abh3021.

3.Andrew C. Yang,et al.A human brain vascular atlas reveals diverse mediators of Alzheimer’s risk.Nature.2022.DOI: 10.1038/s41586-021-04369-3.

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