宏基因组测序

宏基因组测序

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产品详情

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提供商 :上海中科新生命生物科技有限公司

服务名称 :宏基因组测序

· 产品定义

宏基因组学(metagenomics)以环境样品中的微生物群体所有基因组作为研究对象,利用基因组学的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。

与扩增子测序相比,宏基因组测序不仅对于物种鉴定精度更高,更能同时注释KEGG、CAZy、COG、CARD等功能数据库,获得数倍于扩增子测序的微生物组组成及功能信息。

 

· 技术路线

 

· 技术优势

1. 样本处理经验丰富:粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本

2. 平台优:基于优质的Illumina测序平台,数据质量高

3. 分析内容丰富:可选择与各种代谢组学产品进行组学联合分析

 

· 数据分析

 

· 部分数据分析结果展示

 

· 推荐组合产品

1. 宏基因组+代谢组:环境/宿主表型变化的微生物互作研究

2. 宏基因组+16S:环境/宿主微生物群落结构和功能潜能研究

3. 宏基因组+代谢组+转录组:宿主和微生物的协调响应机制研究

 

· 推荐应用领域

1. 代谢病研究:肥胖、糖尿病等代谢疾病与肠道菌群的关联

2. 肿瘤研究:肠道微生物调控肿瘤免疫作用机制

3. 营养科学:功能性食品及畜禽饲料的功效机制研究

4. 生物能源:生物质降解微生态研究

5. 环境科学:污染物降解、耐性基因抗性分布等研究

 

· 送样建议(特殊样本可直接咨询我们)

 

· 项目案例

文献名称:919 Syrup Alleviates Postpartum Depression by Modulating the Structure and Metabolism of Gut Microbes and Affecting the Function of the Hippocampal GABA/Glutamate System

发表期刊:《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》(IF=5.293)

合作单位:复旦大学附属金山医院

文章摘要:产后抑郁症(PPD)是一种影响世界各地孕妇的精神障碍,对母亲、家庭和儿童均有严重后果。919糖浆作为一种中草药,在临床和实验研究中已证明对治疗产后抑郁症有益,然而其作用机制尚不清楚。919糖浆经口摄入,使得药物与肠道微生物群之间的潜在相互作用不容忽视。我们比较了对照健康对照小鼠、PPD小鼠和给药PPD小鼠的海马代谢和粪便代谢物水平和肠道菌群的变化,发现海马中的4-氨基丁酸(GABA)以及多个关键肠道细菌种类与PPD行为相关,并确定了潜在的PPD小鼠肠道微生物群功能的代谢标记物。

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