BioAccel 基于FPGA的高性能计算加速开发平台

BioAccel 基于FPGA的高性能计算加速开发平台

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提供商 :上海惠研生物科技有限公司

服务名称 :让计算加速变得简单易行

规格 :欢迎致电询价。


让计算加速变得简单易行

BioAccel实例使用FPGA实现自定义硬件加速交付。易于编程,并且配备了开发、模拟、调试和编译硬件加速代码所需的各种资源,包括 BioAccel Developer 开发接口,并支持在云上进行硬件级开发。使用BioAccel 实例部署硬件加速在许多应用程序中都非常有用,可解决需要高带宽、增强型联网和超高计算能力的复杂科学问题。 可受益于 BioAccel 实例加速的目标应用涉及基因组学、搜索/分析、图片和视频处理、和文件压缩以及大数据分析。 从低级硬件开发人员到更熟悉 C/C++ 和 openCL 环境的软件开发人员,都有合适的环境。FPGA 设计完成后,您可以将其保存为比特流镜像,然后将其部署到您的BioAccel 实例中,只需单击几下即可完成部署。
从低级硬件开发人员到更熟悉 C/C++ 和 openCL 环境的软件开发人员,都有合适的环境。FPGA 设计完成后,您可以将其保存为比特流镜像,然后将其部署到您的BioAccel 实例中,只需单击几下即可完成部署。


 

技术优势


可扩展的高性能计算

 

与本地系统不同,在 BioAccel 实例上运行高性能计算几乎可以实现无限的容量来扩展您的基础设施,并且让您可以按照工作负载需求轻松灵活地更改资源。您可以配置资源以满足应用程序的需求,并在几分钟内启动所需数量的 FPGA 实例,且只需按实际使用量付费。




 

计算时间最多可缩减 100 倍

 

与 CPU 相比,BioAccel 实例可将速度提升高达 100 倍,适用于各种受计算限制的应用程序。客户可以直接在开发者项目和程序库中发现、测试和部署自定义加速器,从而轻松加速他们的计算流程。无需了解如何对 FPGA 进行编程。



功耗锐降

 

每瓦的功率不仅在边缘很重要,而且在数据中心的功率預算中,无论是空间还是电力成本。FPGA 能够提供新的高效率,但每瓦的功耗远远低于 CPU。
节省时间的同时,也大大减少计算能源消耗,最高减少150倍电能,既能环保,也能节约您的预算。


轻松加速开发

 

借助基于BioAccel云的高级工具和流程管理工具包,开发人员可以专注于程序开发本身,无需关注FPGA本身的编程逻辑,从而加速其 FPGA 的开发部署与应用,让开发人员可以在不依赖FPGA硬件的水平上实现程序代码的0转换, 毫不费力的实现加速的目标。

 

应用领域

 

加速人工智能模型

Accelerated ML models

 

BioAccel的加速ML套件可用于显著加速广泛使用的机器学习应用程序,如logistic回归和K-means聚类。它还允许多个用户共享可用资源,并可扩展部署到多个FPGA卡。可用加速器包括:
深度神经网络
逻辑回归
k - means聚类
朴素贝叶斯
XGboost

 

加速基因组分析

Accelerated Genomics Analysis
 

BioAccel的加速ML套件可用于显著加速广泛使用的生物信息学算法,如基因组比对,变异体分析等。
BWA
GATK
Bioconductor Packages
Python Packages
 

加速图像分析

Accelerated Image Analysis
 

BioAccel的加速ML套件可用于显著加速广泛使用的图像识别算法,加速生物医学图像的数据分析。
深度神经网络

加速数据压缩

Accelerated File Compression

BioAccel的加速ML套件可用于显著加速广泛使用的GZ等压缩算法,加速来自测序中心等大规模实验数据生产线下机数据的压缩,转码等任务,节省时间与存储投入。
gz
tar


 

平台功能


BioAccel FPGA 管理器是一个框架,该框架允许使用简单的编程模型跨FPGA资源集群在大数据集上进行分布式加速。它旨在从单个器件扩展到多个FPGA,每个FPGA都提供本地计算和存储。它还允许自动共享来自多个应用程序,进程和用户的资源。它促进了FPGA集群的轻松部署,扩展和资源管理

无缝整合
 

BioAccel 提供了所有必需的高级功能(API),可通过将计算量最大的任务卸载到FPGA来轻松加速应用程序。无需修改您的应用程序或使用陌生的并行编程语言(例如OpenCL)。您可以从C / C ++,Scala和Python Shell交互使用它。



BioAccel管理器允许无缝共享FPGA资源。允许动态资源管理和自动将加速功能调度到FPGA集群。它还允许自动管理比特流。
多线程
多个任务
多种应用
多个用户



 

FPGA 软件应用/比特流库
 

BioAccel 为软件开发人员完成比特流解码,软件开发人员不再需要使用位流。FPGA 资源管理器根据请求的功能调用自动获取正确的比特流,并处理FPGA的编程和调度,像其他软件库一样轻松部署FPGA。


 

合作模式






 

产品详细信息



 

合作伙伴







 

惠研云 | DaaS数据即服务 开创科学研究新思路 
0 经验 0 背景的生物信息学小白也能立马上手


惠研生物致力于转化医学的技术研发服务为肿瘤基因组与疾病基因组提供强有力的大数据分析平台依据临床需求,为医生科室医院级别构建专病特色数据库通过AI遗传解读系统为临床患者提供自动化全方位解读病情,诊疗的方案,为患者获取更大获益的质量方案;为医生临床科研联动提供信息化平台。

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我们的优势

  • 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,实验周期短,质量可靠。

  • 拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。

  • 技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。

  • 拥有专业的生物信息团队和超算服务器,可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。
     


 

惠研生物科技服务内容
 

  • 科研方案咨询服务

  • 课题基金申请指导

  • 实验方案设计服务

  • 整体实验实施服务

  • 生物统计与数据挖掘

  • 临床支持与转化服务

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服务流程
整体实验技术服务分为两种类型:

  1. 当提供方案时,进行可行性评估并进行报价,然后进行反馈沟通,最终敲定方案执行;

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