中药网络药理学研究

提供商 ：研载生物

服务名称 ：中药网络药理学研究

r 背景介绍

中药复方由两味或两味以上药味组成，具有所含化学成分复杂、药理作用具有多靶点、多途径、多层次的特点，致使中药复方药理研究往往遇到中药物质基础不清、作用机制不明、研究基础与临床应用脱节等问题。网络药理学讲究整体性、系统性、相互作用，所以网络药理学应用于中药复方就可以用来阐释中药作用机制、发现中药药效物质/活性组合物，为新药的发现与研究提供新思路。网络药理学流程一般是通过检索TCMSP等中医药数据库和PharmMapper等靶点数据库，获得疾病的主要活性成分和靶点。结合GEO芯片数据及DrugBank等疾病数据库。获得两者交集基因，构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，根据拓扑结构筛选核心靶点。然后对网络进行GO和KEGG富集分析，建立Herbs-Components-Targets网络和Core Targets-Signal Pathways网络。最后用分子对接技术验证主要化合物-靶点。
r 数据来源
基因表达谱（GEO数据库）、中药数据库（TCMSP、TCMID）
r 分析流程

r 参考文献
Gu S, Xue Y, Gao Y, Shen S, Zhang Y, Chen K, Xue S, Pan J, Tang Y, Zhu H, Wu H, Dou D. Mechanisms of indigo naturalis on treating ulcerative colitis explored by GEO gene chips combined with network pharmacology and molecular docking. Sci Rep. 2020 Sep 16;10(1):15204. doi: 10.1038/s41598-020-71030-w. PMID: 32938944; PMCID: PMC7495487.