肿瘤中代谢相关基因特征的构建及预后意义研究

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提供商 :研载生物

服务名称 :肿瘤中代谢相关基因特征的构建及预后意义研究

背景介绍

肺癌是全世界最常见的癌症,每年导致高死亡率。代谢通路在肺癌的发生和发展中起着至关重要的作用。本研究旨在基于代谢相关基因 (MTG) 特征建立肺腺癌 (LUAD) 患者的预后预测模型。从TCGA-LUAD 队列中筛选出差异表达 (DE)-MTG。对这些 DE-MTG 进行单变量 Cox 回归分析以鉴定与预后显著相关的基因。对所得基因进行LASSO回归以建立最佳风险模型。生存分析用于评估模型的预后能力。基因特征的预后价值在独立的GEO 数据集中得到进一步验证。作者构建了一个具有 13 个代谢基因的基因特征作为独立的预后因素。 Kaplan-Meier 生存分析证明了风险模型在 TCGA 训练和 GEO 验证队列中的良好表现。
数据来源
基因表达谱(TCGA数据库、GEO数据库)
分析流程
图片15.png
参考文献
He L, Chen J, Xu F, Li J, Li J. Prognostic Implication of a Metabolism-Associated Gene Signature in Lung Adenocarcinoma. Mol Ther Oncolytics. 2020 Oct 4;19:265-277. doi: 10.1016/j.omto.2020.09.011. PMID: 33209981; PMCID: PMC7658576.
 

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