预测癌症患者总体生存率的新型铁死亡相关基因特征构建

提供商 ：研载生物

服务名称 ：预测癌症患者总体生存率的新型铁死亡相关基因特征构建

r 背景介绍

肝细胞癌（HCC）是一种高度异质性的疾病，预后预测具有挑战性。索拉非尼可诱导铁死亡，一种铁依赖性的受调节细胞死亡形式。然而，铁死亡相关基因在 HCC 中的预后价值仍有待进一步阐明。在本研究中，作者从公共数据库下载了 HCC 患者的 mRNA 表达谱和相应的临床数据。使用LASSO-Cox 回归模型在 TCGA 队列中构建多基因特征。来自 ICGC 队列的 HCC 患者用于验证。结果表明，在 TCGA 队列中，大多数铁死亡相关基因在 HCC 和相邻正常组织之间存在差异表达。在单变量 Cox 回归分析中，26 个差异表达基因 (DEG) 与总生存期 (OS) 相关。构建了一个 10 个基因的特征signature，将患者分为两个风险组。与低风险组患者相比，高风险组患者的 OS 显著降低。在多变量 Cox 回归分析中，风险评分是 OS 的独立预测因子。ROC曲线分析证实了该signiture的预测能力。
r 数据来源
     基因表达谱（TCGA数据库、ICGC数据库）
r 分析流程

r 参考文献
Liang JY, Wang DS, Lin HC, Chen XX, Yang H, Zheng Y, Li YH. A Novel Ferroptosis-related Gene Signature for Overall Survival Prediction in Patients with Hepatocellular Carcinoma. Int J Biol Sci. 2020 Jul 6;16(13):2430-2441. doi: 10.7150/ijbs.45050. PMID: 32760210; PMCID: PMC7378635.