Low Cell ChIP Kit 低细胞量ChIP-Seq试剂盒 53086

供应商 ：Active Motif

库存 ：大量

样本 ：详询

标记物 ：详询

适应物种 ：详询

应用 ：详询

检测方法 ：详询

检测限 ：详询

规格 ：16 rxns

Active Motif的低细胞ChIP-Seq试剂盒提供了一个完整的ChIP-Seq工作流程，用于染色质制备、免疫沉淀和下一代测序（NGS）文库的制备，这些文库来自有限的细胞或小型组织活检。要了解这些功能与我们提供的其他ChIP试剂盒的比较，请看我们的ChIP试剂盒选择指南。

低细胞数量建议表



该检测方法足够强大，可与高丰度组蛋白修饰和低丰度转录因子蛋白一起工作。包括Next Gen DNA Library和Next Gen DNA Indexing试剂，以生成与Illumina®平台兼容的高复杂性测序库。

ChIP-Seq是一种方法，传统上需要在每个免疫沉淀反应中使用数百万个细胞来生成全基因组的组蛋白修饰或转录因子结合图谱。低细胞ChIP-Seq试剂盒不仅降低了样品的输入要求，而且还解决了通常与低细胞ChIP相关的问题，包括信号-噪声差、库扩增效率低和重复率高。


低细胞ChIP-Seq试剂盒亮点
可重复的组蛋白修饰或转录因子的ChIP-Seq数据，只需1,000个细胞就能获得。
完整的ChIP-Seq工作流程包括染色质制备、免疫沉淀和Illumina兼容的NGS文库制备试剂，这些试剂已经过优化，可用于有限的细胞数量。
阻断试剂和优化的协议提高了信噪比，以获得更好的峰值调用和更低的背景
分子标识符（MIDs）被纳入P5适配器中，用于保留片段重复和去除PCR重复，以增加独特排列的数量。
在同一个测序流动池中最多可复用16个样本
Low Cell ChIP-Seq试剂盒包含足够的试剂来进行16次ChIP-seq反应。包括的一些ChIP缓冲液、阻断剂和蛋白G捕获试剂也可以单独购买。


第一次使用低细胞ChIP-Seq试剂盒？
用低细胞优化模块确保你的成功!
低细胞ChIP-Seq优化模块（货号53085）使研究人员能够监测低细胞ChIP-Seq方案中每个关键步骤的成功与否，并在使用他们宝贵的样品前优化实验。该优化模块还使科学家能够评估低细胞数染色质制备的质量，以确保低细胞数ChIP-Seq实验的最佳结果。


低细胞ChIP-Seq试剂盒组分和储存温度
请注意，Low Cell ChIP-Seq试剂盒是用干冰运输的，里面含有多种储存温度的试剂。所有成分在首次使用前可以储存在-20°C，然后我们建议将每个成分储存在以下的温度。所有试剂在正确储存的情况下，保证自收到之日起稳定6个月。每个试剂盒包括以下成分。

低细胞ChIP-Seq试剂盒组分

• 10X PBS; Store at -20°C
• Proteinase K (10 µg/µl); Store at -20°C
• Blocker; Store at -20°C
• Blocking Reagent AM1; Store at -20°C
• BSA; Store at -20°C
• 100 mM PMSF; Store at -20°C
• Protease Inhibitor Cocktail (PIC); Store at -20°C
• Carrier; Store at -20°C
• Fixation Buffer; Store at 4°C
• Protein G Agarose beads; Store at 4°C
• TE, pH 8.0; Store at RT
• 5 M NaCl; Store at RT
• Stop Solution; Store at RT
• ChIP Filtration Columns; Store at RT
• ChIP Buffer; Store at RT
• Wash Buffer AM1; Store at RT
• Elution Buffer AM4; Store at RT
• LiCl Buffer; Store at RT
• 1.7 ml siliconized tubes; Store at RT

低细胞数ChIP-Seq数据

什么是低细胞数？

使用低细胞数ChIP-Seq试剂盒，研究人员可以在细胞数有限的样品上进行ChIP-Seq检测，而这些样品以前是不适合ChIP的。如果处理有限的样品量，难以培养的细胞系，或小的组织活检，该试剂盒是理想的选择。

下面列出的推荐细胞数是用于每次染色质制备的细胞数量。然后将整个染色质样品用于一次免疫沉淀反应。这与其他ChIP检测不同，在其他ChIP检测中，染色质必须从较大的细胞数量中制备，然后将染色质稀释后用于免疫沉淀中。

推荐细胞数表

表1：使用低细胞ChIP-Seq试剂盒的最小推荐细胞数。建议的最小细胞数是基于目标蛋白丰度和抗体亲和力。
其他影响推荐细胞数的因素包括细胞类型、目标蛋白的丰度和ChIP-Seq抗体的质量。下面是一些来自Active Motif的经过验证的抗体，可与低细胞ChIP-Seq试剂盒一起使用。 
 低细胞ChIP-Seq验证的抗体

蛋白质靶标	货号	已测细胞类型
H3K4me1	39297	GM12878
H3K4me3	39159	MDA-MB-468; GM12878
H3K9ac	39918	GM12878
H3K9me3	39161	GM12878
H3K27ac	39133	HepG2
H3K27me3	39155	MDA-MB-468
CTCF	61311	MDA-MB-468
BRD4	91301	MDA-MB-468

表2：Active Motif的低细胞ChIP-Seq验证抗体。
 

Active Motif的低细胞ChIP-Seq试剂盒用于生成ChIP-Seq数据，使用针对bromodomain-containing 4（BRD4）蛋白的抗体，从10000个MDA-MB-468细胞，或使用针对组蛋白H3K27ac或组蛋白H3K27me3的5000个GM12878细胞。在ChIP之后，使用附带的Next Gen DNA文库套件和Next Gen索引套件制备与Illumina兼容的测序文库，并使用NextSeq 500进行测序。结果显示，对于活性和抑制性组蛋白修饰，只需5,000个细胞就能获得高质量的ChIP-Seq峰，对于BRD4，只需10,000个细胞就能获得。峰值与使用2000万个细胞的ENCODE数据集进行了比较。


图1：低细胞ChIP-Seq的BRD4、H3K27ac和H3K27me3的峰值与ENCODE数据集相比。

下面是低细胞ChIP-Seq试剂盒数据的摘要，使用了强壮和低丰度的目标蛋白。在组蛋白修饰H3K4me3、H3K4me1和H3K27me3方面，仅从1,000个细胞中观察到高于背景的漂亮峰值。活跃的和压抑的组蛋白修饰都被显示出来，表明该方法足够敏感，即使在处理压抑的染色质时也能获得良好的ChIP-Seq信号。低丰度的蛋白质，包括BRD4和绝缘体蛋白CTCF，在只有10,000个细胞的情况下显示了良好的ChIP富集。显示的结果来自一个低细胞ChIP-Seq试剂盒的反应，然而，数据在多个实验中都是可重复生成的。


图2：针对组蛋白和低丰度蛋白的各种低细胞ChIP-Seq试剂盒实验的总结。


 


Active Motif公司是一家致力于研发和生产核细胞分子生物学和表观遗传学研究用试剂的专业公司，也是世界著名的转录因子试剂生产商和CHIP-seq外包服务供应商。

Active Motif的产品涉及：表观遗传学相关抗体、Chip级别抗体、重组识别子和催化酶、预甲基化修饰的重组组蛋白、多聚核小体和生物素标记核小体；以及各类染色质分析、转录因子表达调控分析和DNA甲基化分析的试剂盒等。


产品详情欢迎点击链接进入官方网站查询。
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