NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2

库存 ：1

英文名 ： NadPrep® EZ DNA Library Preparation

供应商 ：纳昂达（南京）

保存条件 ：-20℃

NadPrep^® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 是基于 A-T 连接原理，针对 Illumina & MGI 高通量测序平台开发的双链 DNA 文库构建试剂盒。本试剂盒操作流程简单，在单个步骤内完成对样本的片段化、末端修复和加 A，适用于投入 5‒500 ng DNA 的全基因组测序，同时兼容液相杂交靶向捕获测序。 

产品特色

● 适用于多类型样本，包括：gDNA、FFPE B⁺/B/C/D 级 DNA 样本
● DNA 片段化长度灵活可控
● 片段化、末端修复和加 A 一步完成，体系灵活、操作简便
● 文库产出稳定高效，覆盖均一，低 GC 偏好性
● 低背景噪音（酶切副产物引入的异常序列）
● 兼容自动化工作站平台 

建库流程

产品表现

文库产出稳定高效

图 1. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 对不同起始量 gDNA 样本的建库产出。NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2 (NadPrep® Enfrag v2) 分别搭配 A. NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®) 和 B. NadPrep® Universal Adapter (SI) Module (for MGI) 和 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库，酶切 25 min，文库扩增参考推荐循环数。

兼容不同类型样本

图 2. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 对不同类型样本的建库产出。NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 A. NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®) 和 B. NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库，酶切时间和扩增循环数文库扩增参考相应说明书。
注：样本分级标准 | gDNA：~ 15 kb 有明亮单一不拖尾条带；FFPE B+：~ 15 kb 有主带，存在轻微弥散，主带比弥散状带明显；FFPE B：~ 15 kb 有隐约可见主带，同时存在中度弥散；FFPE C：条带主要分布在 200-2500 bp，呈弥散状；FFPE D：条带主要分布在 250-1000 bp，呈弥散状。

片段化长度灵活可控

图 3.  不同类型样本在不同酶切条件下的文库片段分布。A. 250 ng gDNA 样本为起始量，利用 NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®) 构建文库，参照说明书，酶切不同时间，以获得不同长度 DNA 片段；B. 50 ng 不同等级的 FFPE DNA 样本为起始量构建文库，参照说明书，酶切不同时间，以获得 250 bp DNA 片段。

低 GC 偏好性

图 4. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 对宏基因组样本的建库表现。微生物群组 DNA 标准品 (Zymo Research, D6306）经不同文库制备方案比较微生物的检测情况，NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 的 GC 偏好性跟超声片段化文库构建试剂盒相比无明显差异。
注：NadPrep® Sonication: NadPrep® DNA 通用型文库构建模块 (for Illumina®)； NadPrep® Enfrag v2: NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建模块 v2 ，均搭配 NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®)。

引入背景噪音较低

图 5. 不同类型样本经不同文库构建试剂盒建库时文库产出中异常 reads 的占比。gDNA 及不同等级的 FFPE DNA 样本以 50 ng 为起始量，分别采用 NadPrep® Sonication: NadPrep® DNA 通用型文库构建模块 (for Illumina®) 、NadPrep® Enfrag v2: NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建模块 v2、Vendor Q *、 Vendor K* 和 Vendor V* 酶切片段化文库构建试剂盒建库，500 ng 同一建库方案的文库杂交，并通过 NanOnco Plus Panel v2.0 完成捕获，按照 total reads 计算。A. gDNA 样本经不同文库构建方案建库的文库产出及文库中异常 reads 占比 (Illumina 平台)；B. 不同等级 FFPE DNA 样本经酶切片段化文库构建试剂盒建库时文库产出中异常 reads 占比 (MGI 平台)。
注：Artifact rate: 酶切副产物引入的异常序列占比。

优异的靶向捕获表现

图 6. 酶切和超声片段化构建文库的捕获表现。50 ng 不同等级的 FFPE DNA 样本分别进行酶切和超声片段化建库，500 ng 同一建库方案的文库杂交，并以 NanOnco Plus Panel v2.0 (2.6 M) 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 和 NadPrep® NanoBlockers (for Illumina®) 组成完整的杂交捕获方案，测序数据取 2 M reads pair 分析，不同建库方案的文库捕获数据在 A. 比对率和中靶率方面的表现基本保持一致，但在 B. Fold 80 penalty，C. Duplication rate (重复率) 和 D. Mate on differ chr (自连率) 方面的表现均优于竞品。 

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。