DNA甲基化检测

提供商 ：海普斯

服务名称 ：DNA甲基化检测

技术简介：
DNA甲基化是最常见的表观修饰类型，通常发生在基因组上CG二碱基的C碱基上。DNA甲基化检测技术是对特定条件下组织和细胞内目标区域或全基因组上的甲基化情况进行定量的技术，其中全基因组范围内的检测技术主要包括全基因组亚硫酸氢盐测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）、甲基化DNA免疫共沉淀测序（MeDIP-Seq，Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing）以及以Illumina 450K及850K芯片为代表的 DNA甲基化芯片（DNA methylation microarray）等。除此之外，通过长片段的三代单分子实时测序，可以在单碱基分辨率上检测样本全基因组范围内的甲基化状态。
应用方向：














发展趋势：
DNA甲基化作为最早被发现的表观修饰之一，其主要发生在基因组CG二碱基的C碱基上，正常的基因组甲基化水平在维持细胞、组织正常功能以及各种复杂疾病如癌症、糖尿病等中起着重要作用。特定基因启动子区的高甲基化会诱导基因沉默，其中抑癌基因启动子区的高甲基化是多种癌症发生的重要机制，所以特定疾病状态下的甲基化检测将有助于我们理解疾病的发病机制。WGBS技术是DNA甲基化研究的黄金标准，可在全基因组范围内评估单个C碱基的甲基化水平，用于构建精细甲基化图谱。MeDIP-Seq技术则可高效、经济地比较大样本量细胞、组织等样品间的相对甲基化差异。DNA甲基化芯片相对灵活度更高，并且现在市场流行的Illumina 450K和850K覆盖了基因组上绝大多数的已知基因、CpG位点以及CpG岛区域，且其成本相对较低，是当下人们进行相关研究时用的主流DNA甲基化的检测工具。
服务范围：
针对DNA甲基化，我司提供包括但不限于基于组织和细胞的测序/芯片文库构建、测序/芯片等实验服务以及包括基于甲基化测序和芯片的原始数据质控和过滤、甲基化定量、组间差异甲基化分析、差异甲基化位点注释、表观位点关联分析（EWAS，Epigenome-wide Association Analysis）差异甲基化位点的基因组特征分布和功能富集分析、基于差异甲基化位点的转录调控分析等流程化和定制化的生物信息分析服务，以DNA甲基化芯片为例，核心分析结果示例如下：
1. 差异甲基化分析及差异甲基化位点基因组特征分布

2. EWAS分析

3. 差异甲基化位点功能富集分析

4. 基于差异甲基化位点的转录调控分析