实验方法

酵母菌RNA制备实验

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原理酵母核酸中RNA含量较多,DNA含量则少于2%。RNA可溶于碱性溶液,当碱被中和后,可加乙醇使其沉淀,有此可得粗RNA制品。

基本方案(热酸性酚抽提法)

实验原理

1.  酵母细胞在10 ml 培养基中生长至指数中期(OD600=1.0)。
 
2.  将培养液转移到50 ml,离心管,于4℃,1 500 g 离心3 min。
 
3.  弃上清,菌体沉淀用1 ml 冰冷的水重悬,转移至一个干净的1.5 ml 微量离心管中, 4℃离心10 s,弃上清,继续步骤4。需要时,将离心管置于干冰上速冻。
 
4.  用400 μl TSE溶液重悬细胞沉淀,加400 μl 酸性酚,激烈振荡10 s,65℃温育30~60 min,不时用旋涡振荡器短暂振荡。
 
5.  冰浴放置5 min,4℃高速离心5 min。
 
6.  水(上)相移到一个干净的1.5 ml 微量离心管中,加400 μl 酸性酚,激烈振荡,重复步骤5。
 
7.  将水相移到一个干净的1.5 ml 微量离心管中,加入400 μl 氯仿,激烈振荡,4℃高速离心5 min。
 
8.  将水相移到一个新管中,加40 μl 3mol/l 乙酸钠,pH5.3及1 ml 冰冷的无水乙醇沉淀,4℃高速离心5 min,在冰冷的70%乙醇中快速振荡以洗涤RNA沉淀。如上离心以沉淀RNA。
 
9.  沉淀用50 μl 水重溶,用分光光度法测A260及A280以确定浓度,于-70℃或-20℃贮存,可使用1年。

实验材料

酵母菌

试剂/试剂盒

TES 酸性酚 氯仿 乙酸钠 乙醇

仪器/耗材

离心管 离心机 摇床

实验步骤

1.  酵母细胞在10 ml 培养基中生长至指数中期(OD600=1.0)。
 
2.  将培养液转移到50 ml,离心管,于4℃,1 500 g 离心3 min。
 
3.  弃上清,菌体沉淀用1 ml 冰冷的水重悬,转移至一个干净的1.5 ml 微量离心管中, 4℃离心10 s,弃上清,继续步骤4。需要时,将离心管置于干冰上速冻。
 
4.  用400 μl TSE溶液重悬细胞沉淀,加400 μl 酸性酚,激烈振荡10 s,65℃温育30~60 min,不时用旋涡振荡器短暂振荡。
 
5.  冰浴放置5 min,4℃高速离心5 min。
 
6.  水(上)相移到一个干净的1.5 ml 微量离心管中,加400 μl 酸性酚,激烈振荡,重复步骤5。
 
7.  将水相移到一个干净的1.5 ml 微量离心管中,加入400 μl 氯仿,激烈振荡,4℃高速离心5 min。
 
8.  将水相移到一个新管中,加40 μl 3mol/l 乙酸钠,pH5.3及1 ml 冰冷的无水乙醇沉淀,4℃高速离心5 min,在冰冷的70%乙醇中快速振荡以洗涤RNA沉淀。如上离心以沉淀RNA。
 
9.  沉淀用50 μl 水重溶,用分光光度法测A260及A280以确定浓度,于-70℃或-20℃贮存,可使用1年。

注意事项

不要用高浓度的细胞制备RNA,因为进入静止期后,结果的一致性差,RNA产量不稳定。

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