实验方法

MTT 的操作方法(四)

2016-08-16 15:41

MTT 结果分析

关于如何计算 IC50

1、改良寇式法:lgIC50=Xm-I(P-(3-Pm-Pn)/4)

Xm:lg 最大剂量

I:lg(最大剂量/相临剂量)

P: 阳性反应率之和

Pm: 最大阳性反应率

Pn: 最小阳性反应率

举个例子:各药物浓度作用于某肿瘤细胞后所得 MTT 值如下



公式中的最大最小阳性反应率就是最大最小抑制率

抑制率=1-加药组 OD 值/对照组 OD 值,如对于 100ug/ml 的药物,其抑制率=1-0.080/0.614=0.869,各组抑制率如下:



代入计算公式:

Pm=0.869

Pn=0.135

P=0.869+0.849+0.616+0.391+0.282+0.135=3.142

Xm=lg100=2

lgI=lg100/50=0.301

lgIC50=2-0.301*(3.142-(3-0.869-0.135)/4)=1.655

IC50=45.186

该药物的IC50值为 45.186ug/ml

最近做一个药物抗呼吸道合胞病毒的药效学试验,看大多数文献里,病毒滴定中的TCID50、药物毒性试验中的半数中毒浓度(TC50)最大无毒浓度(TC0)以及药物半数有效浓度(EC50)大多数都用的Reed-Meuench法计算,但文献中对具体的计算方法都没有描述,搜索了园子里面的一些相关的帖子还是一头雾水,不知道是真正懂的人不太多还是还是我没看明白。现在急需搞清这些方法,恳请园内高手赐教!

TCID50=log(CPE高于50% 最高稀释对度)+距离比例×log稀释度间距

计算累积感染百分率(阳性孔是从下往上累积,阴性孔是从上往下累积,计算累积的阳性孔的百分比)

距离比例=(高于50% 的百分数-50)/(高于50% 的百分数-低于50% 的百分数)

举个例子:用上面的累积法得到半数组织感染量在 10-7~10-8之间,距离比例按reed-muench法算出=0.5,那么按照上面的公式TCID50=7+0.5=7.5,病毒的滴度为10-7.5。不知道我这样理解是否正确?算出TCID50后,那么100TCID50如何确定?

药物毒性试验中,药物的剂量2倍递次稀释,假设我得到的数据如下:

剂量mg/ml---CPE百分比

200-------100%
100-------80%
50-------45%
25-------10%
12.5-------0

可以看出TC50为50~100 mg/ml之间的浓度,此时如何套用reed-muench法计算TC50?没有找到现成的公式,只好照葫芦画瓢将剂量数值改成10n。

200=102.3------100%
100=102.0------80%
50=101.7------45%
25=101.4------10%
12.5=101.1------0

由于n是正数,与病毒滴定时绝对值变化方向相反,用reed-muench法时就得倒过来计算,此时:

距离比例=(50-低于50% 的百分数)/(高于50% 的百分数-低于50% 的百分数)

TC50=Antilog[Log(CPE低于50% 药物浓度)+距离比例×log稀释度间距]

按此法计算上面例子:TC50=Antilog(1.7+0.14×0.3)=55.21

不知道我这种算法是否可行,如果错了请大家原谅,小学数学一直不太好

还有TC0是如何得到的,上面的例子中是不是可以认为TC0>12.5 mg/ml?

TCID50=log(CPE高于50% 最高稀释对度)+距离比例×log稀释度间距

计算累积感染百分率(阳性孔是从下往上累积,阴性孔是从上往下累积,计算累积的阳性孔的百分比)

距离比例=(高于50% 的百分数-50)/(高于50% 的百分数-低于50% 的百分数)

举个例子:用上面的累积法得到半数组织感染量在10-7~10-8之间,距离比例按reed-muench法算出=0.5,那么按照上面的公式TCID50=7+0.5=7.5,病毒的滴度为10-7.5。不知道我这样理解是否正确?

完全正确!

算出TCID50后,那么100TCID50如何确定?

将算出来的数值除以100便得到 100TCID50,也是配100个TCID50所需要稀释的倍数

药物毒性试验中,药物的剂量2倍递次稀释,假设我得到的数据如下:

剂量mg/ml---CPE百分比

200-------100%
100-------80%
50-------45%
25-------10%
12.5-------0

可以看出TC50为50~100 mg/ml之间的浓度,此时如何套用reed-muench法计算TC50?没有找到现成的公式,只好照葫芦画瓢将剂量数值改成10n。

200=102.3------100%
100=102.0------80%
50=101.7------45%
25=101.4------10%
12.5=101.1------0

由于n是正数,与病毒滴定时绝对值变化方向相反,用reed-muench法时就得倒过来计算。

不大明白,您这是怎么换算的,或许您只是做个简单的假设,这里n其实是负数,也就是倍比稀释,稀释度间距为-0.3。

此时:

距离比例=(50-低于50% 的百分数)/(高于50% 的百分数-低于50% 的百分数)

TC50=Antilog[Log(CPE低于50% 药物浓度)+距离比例×log稀释度间距]

按此法计算上面例子:TC50=Antilog(1.7+0.14×0.3)=55.21

不知道我这种算法是否可行,如果错了请大家原谅,小学数学一直不太好

到这一步还是没有问题的

还有TC0是如何得到的,上面的例子中是不是可以认为TC0>12.5 mg/ml?

TC0 我就不大理解了,我做的是病毒中和抗体实验,需要注意的是,在表示滴定的病毒的结果时一定要写出用了多少病毒,比如,滴定时用的是 100 微升的病毒,那么显示结果时要写成 TCID50=4.3350log10/100 微升(这里的数值 4.3350 只是举例)

再次请教 yvette,在做药物对病毒抑制实验的时候,50% 的抑制浓度或者药物半数有效浓度(EC50)计算的时候与上面病毒滴定或药物毒性有什么区别吗?

看一篇文献上的例子:

----------------------------累积-----

剂量--每孔 CPE 程度--平均 CPE--CPE 抑制程度--CPE 抑制-CPE-抑制率 (%)

10-0.3--1112-----1.25----2.75----8.75--1.25---87.5

10-0.6--1122-----1.50----2.50----6.00--2.75---68.57

10-0.9--1223-----2.00----2.00----3.50--4.75---42.42

10-1.2--3334-----3.25----0.75----1.50--8.00---15.79

10-1.5--3344-----3.50----0.50----0.75--11.50---6.12

10-1.8--3444-----3.75----0.25----0.25--15.25---1.61

从上面这个例子可以看出 CPE 是从上往下累积,而 CPE 抑制从下向上累积(这里是病变分数累积,有些好像是病变孔数累积)。在这里的算法是不是与前面的有所不同,计算公式上有什么变化吗?

这种算法我倒是没有看到过,不过看起来也有道理,一般是每个稀释度做 4 个复孔(如果要更准确一点,做 8 个复孔,不过工作量太大),然后看出现 CPE 的孔数(我做流感的时候,因为观察 CPE 不是太客观,因为有时候细胞状态不好时。

虽然没有病毒增殖,但是从显微镜下看细胞也变圆、收缩,看起来像是 CPE 的症状,所以我一般是在第三天时每孔取 50 微升加鸡红细胞做血凝试验,如果有血凝,那么就表示有病毒增殖,就算是有 CPE),CPE 也有程度的不同,这儿他好像是将 CPE 分为 4 个等级,这可能跟不同的病毒有关,有的病毒引起的 CPE 只有“有”和“无”之分。

这儿也是每个稀释度做了 4 个复孔,记录结果时,观察每个孔的 CPE 程度,算出每个稀释度的平均 CPE,因为完全的 CPE 为4,所以每个稀释度 CPE 被抑制的程度就是用 4 减去该稀释度的平均 CPE,那么上表中,倒数第三列是,CPE 被抑制程度的累积。

相当于做病毒滴定时的阳性孔累计数,是从下向上累积;上表中倒数第二列为平均 CPE 的累积,是从上向下累积,那么每个稀释度 CPE 被抑制的比率就=CPE 被抑制程度/(CPE 被抑制程度+平均 CPE),

算法应该是一样的,从表上也可看出,50% 的抑制浓度应该在10-0.6 到10-0.9 之间。

距离比例=(68.57-50)/(68.57-42.42)=0.7101

50% 的抑制浓度的对数=0.6+0.7101X0.3=0.8130

50% 的抑制浓度=1:6.501

请教:重组腺病毒载体(非复制型的)在感染的目的细胞中(体内和体外)可以持续表达多长时间?

如果用 MOI=100 的病毒感染细胞,与 100TCID50 感染细胞是一样的么?

不好意思,新手上路,还请上面的各位大虾多多指教。不过有一点搞不清楚,你们为什么不用 spass 软件算了,这样用 Reed-Meuench 法人工算头都大了,还可能算错。用软件只用输入数据就够了。

我算了一下,你的 TCID50 应该是 65.78668,还可以同时得到你的药物毒性曲线。依据你这一次的数据 TC0 应该是个负数。

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来源:丁香园

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