实验方法

<下载>第一届蛋白质组学会议课件-贺福初篇

2015-07-24 10:50

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人物介绍:贺福初老师,中国蛋白质组学绝对的number 1(y)(y)
毕业于复旦大学生物系,1985年在军事医学科学院放射医学研究所获硕士学位。现为中国科学院院士、军事医学科学院放射医学研究所所长、研究员、博士生导师,技术4级,大校军衔,同时,为复旦大学生物医学研究院院长。2002年初,作为首席科学家,领衔了在未来5年内资助额达3500万元的“973”重大研究项目——“人类重大疾病的蛋白质组学研究”,也是首次由我国领导的重大国际合作计划“人类肝脏蛋白质组研究计划”的执行主席。(y)
现为蛋白质组学权威杂志Proteomics 编委。

课件题目:人胎肝蛋白质组及其与转录组的比较
课件简介:主要介绍他们肝脏蛋白质组的一些相关工作,分为如下6个方面:
1、基因表达谱
利用大规模cDNA测序,完成了15,000多个表达序列标签(EST)的测定。完成了胎肝基因表达谱的构建, 其中含1660个已知基因,5千余个代表新基因的
ESTs。
2、蛋白质表达谱
指出了人胎肝蛋白质表达谱研究策略,
a、2DE→MS 、SDS-PAGE →MS 及2DLC-MS 研究胎肝中高丰度蛋白质
b、血清白蛋白抗体去除胎肝中存在的高丰度蛋白质,使中低丰度的蛋白质得到相对富集
c、亚细胞蛋白质组策略富集低丰度蛋白质
及其技术路线(很经典的方法)和窄范围胶条的应用。
3、亚细胞蛋白质组
提到了胎肝蛋白质的亚细胞分离策略和应用各种不同技术体系鉴定细胞核、细胞膜和线粒体的蛋白数目和各亚细胞器特有蛋白数。
4、磷酸化蛋白质表达谱
指出了其技术路线,特点主要有通过免疫印迹富集到一些磷酸化蛋白。然后指出了鉴定的磷酸化丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸蛋白数目和功能分类,还作了磷酸化蛋白质的蛋白丰度及磷酸化水平的相对定量和分析结果。
5、蛋白质相互作用连锁图
主要通过大规模的酵母双杂交和生物信息学预测两种方法建立蛋白质相互作用连锁图。然后指出了各自的方法和一部分结果。
6、转录组与蛋白质组的比较
首先提出:转录组和蛋白质组究竟多大程度上能相互预测?如果相关性很弱(无法相互预测),那么只有同时测量转录组和蛋白质组,并对之进行比较分析,才能系统地理解整个生物系统。
然后提到了他们团队建立的人胎肝转录组和蛋白质组。并得出结论:胎肝蛋白质组和转录组的丰度呈弱相关性。

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来源:丁香园论坛

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