新生，第一次来发帖，
请教：
PCR做出加药后上调的趋势，但是Western却是下调。
应该怎么解释呢？
如果能附上相关文献的检索就更好了。
谢谢！！！

在回答这个问题前，请楼主回答几个问题：

1、你的“PCR和Western的结果不相符”这个结论，是重复几次试验后，观察到的结果？
2、你的PCR样品和WB样品来自体外还是来自体内？
3、你的PCR是常规PCR，还是定量PCR，还是定量RT-PCR？
4、你的PCR和WB中，阳性和阴性对照分别是什么？
5、你的药物，可能在哪个水平发挥作用？
6、你的药物做了几个稀释度，做了几个时间点？

生物学实验的两大基本准则是“对照”和“重复”，你都没有交代清楚，谁也无法答复你的问题。

LZ的问题似乎更关注寻找结果不符的依据 多过对实验本身可信度的分析。

如果是这样的话，不就是自己查文献嘛,谁知道你做的是什么东西

是啊，做的是什么？

我做的PCR是半定量的反转录PCR
刚开始做 技术不好 可能结果不准……
我会继续重复实验的。
谢谢大家的支持……
春节快乐！

Repeat the WB first; acoording to your "可能结果不准……", so that you could know
if prorein level really changes or not . Then semi-qRT_PCR, using the internal control, at least two , e.g. beta actin plus GAPDH .

谈点看法，楼主说PCR做的是半定量，我不太知道什么叫半定量，可能就是普通的PCR啊，理论上来说普通的PCR是没有办法达到定量的目的的，因为进入平台期以后，产物量和初始标本量是不成正比的，这就是为什么要使用荧光PCR定量的目的。
抛开可能存在的技术问题不谈，对于某个基因的调节也存在post-transcription的调节，也就是说绝对不是转录水平和翻译水平是完全一致的，不是说一个分子mRNA上调，那么蛋白肯定上调，因为存在mRNA的修饰，运输，降解和其他一些samll RNA，比如miRNA的调节，因此理论上mRNA水平和蛋白水平也不一定是一致。