网站预测了某个microRNA有两个不同的靶基因，而且，这两个基因都已证实与某一种疾病相关，并两基因间存在相互调控机制。
我应该如何设计实验呢？

这个说起来很简单啊，但是操作起来是比较麻烦的。首先我还是建议你先用生物信息学软件，多用几个预测一下，因为需要实验验证是比较麻烦的事情。如果可以我建议你分为以下几步来验证你的实验：
1.首先构建miRNAs表达质粒！构建质粒注意事项请参考丁香园相应主题。
2.然后讲呢的target的3’UTR连接到荧光素酶的下游。请参考相应文献怎么做。
3.共转染miRNAs质粒和target的3’UTR，检测作用结果。（特别提醒：在共转染之前请用PCR验证你的miRNAs质粒是否表达，否则前功尽弃）

你先做预测吧，看看文献，多用几个在线软件预测，然后取交集，只用一个网站预测得结果不准确。第二步算一下自由能，去掉自由能过高得靶基因。然后剩下的再用试验验证。试验验证的程序园子里有很多，你搜一下。

To poisonkq:
请教一下如何计算自由能，能详细介绍一下吗？
我的邮箱pot 2001@163.com,万分感谢

Mfold可以计算。

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能介绍的具体一些吗？刚刚去看了一下，没太弄明白，谢谢！

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——————————————————————————————————————————————————————————————————————————-对，建议大家公开交流。

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