按照常见的protocol大多使用的是non-denaturing PAGE。其实最早的时候，主要有两种胶，一种是PAGE一种是agarose。但是开始的时候agarose主要是用以比较大的complex，例如TFIID-DNA等。文献可见：
（1）Zerby,D. and Lieberman,P.M. (1997) Functional Analysis of TFIID-Activator Interaction by Magnesium-Agarose Gel Electrophoresis. METHODS: A Companion to Methods in Enzymology, 12, 217-223.
（2）Bellorini,M., Lee,D.K., Dantonel,J.C., Zemzoumi,K., Roeder,R.G., Tora,L. and Mantovani,R. (1997) CCAAT binding NF-Y-TBP interactions: NF-YB and NF-YC require short domains adjacent to their histone fold motifs for association with TBP basic residues. Nucl.Acids.Res., 25, 2174-2181.后来也有人开始尝试用agarose进行EMSA的实验，见我上一贴里的文章，但是图像做出来没有PAGE分的那么开。但是操作上要简单很多。我们实验室也尝试过用agarose，没有什么大的问题。
扫码关注「实验菌」，入科研社群，领学习资源
更有优质直播、研选好物、福利活动等你来！
你可能喜欢