实验方法

构建人类基因组CIRSPR文库

2017-12-15 08:58

动物模型构建

CRISPR-Cas9 系统作为最新一代基因编辑技术,能够简便高效地实现基因组精确 修饰,是制备哺乳动物疾病模型的重要工具。目前科学家利用 CRISPR-Cas9 技术在动物模型,如小鼠、大鼠、猪 和猴等研制方面做出一系列重要工作。如科学家们将 CRISPR-Cas9 系统导入小鼠受精卵,成功获得了有特定基因突变的小鼠模型,并获得近乎 100% 的基因靶向突变效率,极大地降低了基因编辑小鼠模型制备的难度和成本,有望被广泛应用。

背景:

使用自主研发的sgRNA设计平台为一个基因位点设计4条sgRNA,每个文库包含3,000个基因,共设计12,000条sgRNA,将12,000条基因利用芯片技术进行合成,共使用8张芯片,合成了8个sgRNA文库。

方法:

1. sgRNA设计方案

2. 合成用于sgRNA文库构建的专利化的载体

3. sgRNA活性检测

4. NGS测序验证,保障sgRNA文库质量

结论:

1、文库构建的结果(图2、3、4);

2、sgRNA文库正确率高,突变率较低,库容量符合CRISPR文库QC标准。

CRISPR文库构建流程:

泓迅科技在CRISPR文库构建方面有严格的QC标准,具体指标如下:

  1. 文库构建覆盖倍数> 100x

  2. 文库构建库容量> 106

  3. 文库构建正确率70%~95%

  4. 文库构建覆盖度>95%

  5. 内毒素含量<50EU/mg

  6. 偏向性<15

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来源:泓迅科技

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