本人正准备进行课题设计，找到了一个比较感兴趣的抑癌基因，但是不清楚它在我所研究肿瘤中的表达情况。后来看到了我们实验室做的一个关于肿瘤和癌旁组织的基因芯片（需要注明的是由于经费问题只做了一组癌和癌旁组织），发现这个基因在癌和癌旁组织的改变不明显。想咨询各位：仅仅一组癌和癌旁组织的基因芯片是否能够做参考？这个基因在癌中的表达就真得没有变化呢？

一对样本太少，说明不了问题。建议再做上几个样本的RT-PCR看看。

一组不能说明问题哈，其实对你的研究来说，根本不需要在乎别人这个实验的结果如何，你也不必去考虑芯片实验，你只需要做那么几组real time PCR，如果发现问题的话，就可以加以大量样本去证实哈！

基因芯片实验为了提高结果的可信度,应采用两点基因芯片(芯片上每个探针有两个位点).为避免基因芯片质量差异,从统计学角度来说,每实验组至少有5~6块基因芯片才有意义.
摘自 谷志远 赵亚力<<现代医学分子生物学>>第二版245页

基因芯片的可信度远远没有real-time pcr高
一个基因做pcr是最好的选择，芯片不同类型
不同厂家差别很大，我认为不能说明任何意义

对于这个战友，给你一点建议！鉴于实验室的经费问题，我们实验室也只做了一对。但是芯片在很大程度上只是给你一个导向，不是说芯片反应的都是正确的，并且芯片还有做得好的与差的。一般芯片上的东西需要PCR来验证的，如果验证成功才能说明问题。而芯片也有假阴性的，所以如果你在几组病人的肿瘤和癌旁组织能够验证你这个抑癌基因低表达的话，那不是更能说明问题吗。有病人标本这么好的资源不好好利用，哎，真是可惜。但是有一点，芯片在很大程度上是一个高通量筛选，能给你一些提示。所以不要完全否定芯片的结果，也不要盲目的相信，你实验做出来是什么可以重复，那么你的抑癌基因肯定没有问题。呵呵，加油。我认为你看的这个抑癌基因是最近文献里面报道而又没有证实的，我也发现了好几个。也正准备验证，可是苦于无组织标本，好羡慕你啊！