实验方法

利用模块装配方法构建锌指 核酸酶以位点特异的方式操作基因组实验

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同源重组是基因组操作中最精确的一种方法。作为一个工具,同源重组已经广泛地用于细菌、酵母、鼠胚胎干细胞(E S ) , 以及其他一些特殊细胞系,但在其他系统如哺乳动物体细胞遗传学上还没有得到应用。最近的研究工作表明,在哺乳动物体细胞中,双链 D N A 发生基因特异的断裂,能够引起上千倍的同源重组。目前,利用锌指核酸酶(Z F N ),能够在哺乳动物基因组中形成这种双链断裂。 Z F N 是一种人工蛋白质,由一个铸指D N A 结合结构域与一个非特异性的核酸酶结构域融合而成。本章描述如何鉴定Z F N 切割的潜在靶向,如何使 Z F N 切割该靶向位点,以及测定这些新设计的Z F N 在培养的哺乳动物细胞系统中是否有活性。
作者:T.弗里德曼等,译者:殷勤伟等,本实验来自「基因转移」

利用模块装配方法构建 ZFN

实验原理

利用模块装配方法构建 ZFN

材料

试剂

琼脂糖凝胶(2.5%)

牛小肠碱性磷酸酯酶

d N T P (每种10 mmol/L )

转化用大肠杆菌

MgCl2 (50mmol/L )

质粒: pBluescript (p B S --Z F ) 和 p c D N A 6 (Invitrogen)

P C R 片段纯化试剂盒

10 X 聚合酶缓冲液

限制性内切核酸酶: A p a l 、 B a m H I 和 SpeI

T 7 引物

T a g 聚合酶

Zif-ZFN D N A 模板

仪器

37℃加热块或者水浴

按预期的扩增程序工作的循环变温加热器

实验步骤

利用模块装配方法构建 ZFN

材料

试剂

琼脂糖凝胶(2.5%)

牛小肠碱性磷酸酯酶

d N T P (每种10 mmol/L )

转化用大肠杆菌

MgCl2 (50mmol/L )

质粒: pBluescript (p B S --Z F ) 和 p c D N A 6 (Invitrogen)

P C R 片段纯化试剂盒

10 X 聚合酶缓冲液

限制性内切核酸酶: A p a l 、 B a m H I 和 SpeI

T 7 引物

T a g 聚合酶

Zif-ZFN D N A 模板

仪器

37℃加热块或者水浴

按预期的扩增程序工作的循环变温加热器

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