实验方法

质粒DNA的大量制备实验

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内容来源:精编分子生物学指南第五版。

碱裂解法

实验原理

大量碱裂解方法不仅相当快捷可靠,而且可获得相当纯净的粗制DNA。煮沸法的大量制备也简单易行,但得到的DNA比较粗制。高纯度的质粒DNA可通过氯化铯/溴化乙锭平衡离心法或层析法进一步纯化粗制DNA得到。

实验材料

培养基 菌株

试剂/试剂盒

EDTA SDS 乙醇 乙酸钾 异丙醇

仪器/耗材

离心管

实验步骤

1.  往5 ml的含选择性试剂(通常是氨苄青霉素)的LB培养基或丰富培养基接种单菌落。于37°C剧烈振荡培养过夜。

2.  往2 L烧瓶中加入500 ml含有适当抗生素的LB培养基,然后加人1 ml过夜培养的大肠杆菌培养物,再于37°C培养至饱和状态(OD600≈4)。
 
3.  于 4°C,6000 g 离心 10 min。

4.  用4 ml GTE溶液重悬沉淀,并转移到一个容积≥20 ml的高速离心管中。

5.  加入1 ml新配的含25 mg/ml溶菌酶的GTE溶液(终浓度5 mg/ml),彻底重悬沉淀,于室温放置10 min。

6.  加人10 ml新配的NaOH/SDS溶液,并且轻轻混匀直至液体变得均一、清亮而黏稠。于冰上放置10 min。

7.  加人7.5 ml 3 mol/L乙酸钾溶液,用吸管轻轻搅拌直至黏稠度下降并形成大的沉淀,于冰上放置10 min。

8.  于4 °C,20000 g离心10 min,将上清轻轻倒人至另一个干净的离心管中,如果有可见的漂浮物可用数层纱布过滤。

9.  加人0.6倍体积的异丙醇,颠倒混匀,室温放置5~10 min。

10.  室温,15000 g离心10 min。弃上清,加人2 ml 70%乙醇轻轻洗涤沉淀。

11.  室温,15000 g短暂快速离心,吸去乙醇,并真空干燥。4 °C无限期保存。

注意事项

1.  为提髙产量,应采用表面积较大及带折流板的烧瓶以尽量增大通气度;振摇速度大于400 r/min。

2.  如果DNA要用层析法纯化,加人50 μg/ml RNA酶A以降解RNA。